Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmb5O55234 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmb5O55234 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb5O55234 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmb5O55234 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb5O55234 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb5O55234 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb5O55234 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms