Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmbnO55189 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmbnO55189 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmbnO55189 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmbnO55189 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AmbnO55189 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmbnO55189 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmbnO55189 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmbnO55189 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmbnO55189 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmbnO55189 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmbnO55189 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmbnO55189 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmbnO55189 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmbnO55189 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmbnO55189 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmbnO55189 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmbnO55189 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmbnO55189 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmbnO55189 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmbnO55189 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmbnO55189 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmbnO55189 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbnO55189 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbnO55189 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmbnO55189 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms