Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr2O55101 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr2O55101 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr2O55101 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms