Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn20O55082 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn20O55082 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn20O55082 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptpn20O55082 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms