Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SlkO54988 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SlkO54988 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SlkO54988 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SlkO54988 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SlkO54988 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SlkO54988 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SlkO54988 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SlkO54988 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SlkO54988 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SlkO54988 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SlkO54988 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SlkO54988 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SlkO54988 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SlkO54988 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SlkO54988 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SlkO54988 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SlkO54988 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SlkO54988 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SlkO54988 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SlkO54988 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SlkO54988 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SlkO54988 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SlkO54988 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SlkO54988 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SlkO54988 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SlkO54988 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SlkO54988 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SlkO54988 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SlkO54988 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SlkO54988 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SlkO54988 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SlkO54988 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SlkO54988 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SlkO54988 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SlkO54988 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SlkO54988 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SlkO54988 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SlkO54988 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SlkO54988 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SlkO54988 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SlkO54988 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SlkO54988 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SlkO54988 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SlkO54988 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SlkO54988 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SlkO54988 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SlkO54988 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SlkO54988 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SlkO54988 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SlkO54988 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SlkO54988 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SlkO54988 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SlkO54988 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SlkO54988 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SlkO54988 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SlkO54988 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SlkO54988 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SlkO54988 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SlkO54988 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SlkO54988 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SlkO54988 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SlkO54988 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SlkO54988 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SlkO54988 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SlkO54988 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SlkO54988 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SlkO54988 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SlkO54988 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SlkO54988 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SlkO54988 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SlkO54988 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SlkO54988 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SlkO54988 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SlkO54988 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SlkO54988 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SlkO54988 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SlkO54988 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SlkO54988 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SlkO54988 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SlkO54988 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SlkO54988 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SlkO54988 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SlkO54988 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SlkO54988 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SlkO54988 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SlkO54988 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SlkO54988 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SlkO54988 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SlkO54988 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SlkO54988 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SlkO54988 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SlkO54988 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SlkO54988 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms