Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnk2O54967 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnk2O54967 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnk2O54967 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnk2O54967 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnk2O54967 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnk2O54967 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms