Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lgals6O54891 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lgals6O54891 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lgals6O54891 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgals6O54891 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms