Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb3O54890 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb3O54890 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb3O54890 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb3O54890 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb3O54890 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itgb3O54890 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb3O54890 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb3O54890 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb3O54890 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb3O54890 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb3O54890 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb3O54890 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb3O54890 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms