Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3d1O54774 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3d1O54774 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3d1O54774 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3d1O54774 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3d1O54774 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3d1O54774 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3d1O54774 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3d1O54774 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3d1O54774 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3d1O54774 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3d1O54774 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3d1O54774 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.6 ms