Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc4O35988 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Sdc4O35988 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdc4O35988 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc4O35988 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdc4O35988 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdc4O35988 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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