Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FxnO35943 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FxnO35943 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FxnO35943 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FxnO35943 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FxnO35943 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FxnO35943 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FxnO35943 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FxnO35943 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FxnO35943 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FxnO35943 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FxnO35943 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FxnO35943 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FxnO35943 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FxnO35943 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FxnO35943 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FxnO35943 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FxnO35943 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FxnO35943 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FxnO35943 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FxnO35943 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FxnO35943 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FxnO35943 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FxnO35943 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FxnO35943 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FxnO35943 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FxnO35943 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FxnO35943 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FxnO35943 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FxnO35943 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FxnO35943 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FxnO35943 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FxnO35943 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FxnO35943 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FxnO35943 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FxnO35943 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FxnO35943 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FxnO35943 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FxnO35943 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FxnO35943 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FxnO35943 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FxnO35943 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FxnO35943 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FxnO35943 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FxnO35943 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FxnO35943 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FxnO35943 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FxnO35943 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FxnO35943 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FxnO35943 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FxnO35943 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FxnO35943 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FxnO35943 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FxnO35943 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FxnO35943 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FxnO35943 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FxnO35943 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FxnO35943 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FxnO35943 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FxnO35943 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FxnO35943 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FxnO35943 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FxnO35943 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FxnO35943 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FxnO35943 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FxnO35943 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FxnO35943 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FxnO35943 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FxnO35943 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FxnO35943 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FxnO35943 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FxnO35943 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FxnO35943 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FxnO35943 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FxnO35943 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FxnO35943 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FxnO35943 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FxnO35943 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FxnO35943 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FxnO35943 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FxnO35943 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FxnO35943 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FxnO35943 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FxnO35943 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FxnO35943 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FxnO35943 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FxnO35943 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FxnO35943 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms