Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk4O35493 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk4O35493 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk4O35493 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk4O35493 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk4O35493 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk4O35493 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk4O35493 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk4O35493 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk4O35493 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk4O35493 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk4O35493 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk4O35493 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk4O35493 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk4O35493 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk4O35493 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk4O35493 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk4O35493 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk4O35493 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk4O35493 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms