Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccrl2O35457 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccrl2O35457 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccrl2O35457 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccrl2O35457 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccrl2O35457 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 487.5 ms