Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc16a8O35308 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc16a8O35308 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a8O35308 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a8O35308 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a8O35308 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a8O35308 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a8O35308 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a8O35308 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a8O35308 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc16a8O35308 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms