Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn9O35239 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn9O35239 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn9O35239 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn9O35239 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn9O35239 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn9O35239 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn9O35239 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptpn9O35239 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn9O35239 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn9O35239 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn9O35239 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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