Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd9O35177 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd9O35177 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd9O35177 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd9O35177 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd9O35177 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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