Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pitx3O35160 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pitx3O35160 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitx3O35160 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx3O35160 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms