Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kif3cO35066 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3cO35066 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3cO35066 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3cO35066 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms