Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata2O09100 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gata2O09100 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gata2O09100 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gata2O09100 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata2O09100 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gata2O09100 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata2O09100 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gata2O09100 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata2O09100 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata2O09100 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata2O09100 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata2O09100 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata2O09100 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata2O09100 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata2O09100 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata2O09100 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata2O09100 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms