Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24,36■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
PbsnO08976 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,33■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24,33■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
PbsnO08976 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,3■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,29■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
PbsnO08976 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
PbsnO08976 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
PbsnO08976 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24,26■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,25■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24,23■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
PbsnO08976 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
PbsnO08976 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24,18■■□□□ 1,46
PbsnO08976 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24,18■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24,17■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
PbsnO08976 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
PbsnO08976 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,15■■□□□ 1,46
PbsnO08976 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
PbsnO08976 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
PbsnO08976 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24,11■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
PbsnO08976 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
PbsnO08976 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
PbsnO08976 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
PbsnO08976 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
PbsnO08976 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24,01■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23,99■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
PbsnO08976 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23,96■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
PbsnO08976 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23,95■■□□□ 1,42
PbsnO08976 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
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