Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eftud2O08810 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eftud2O08810 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eftud2O08810 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eftud2O08810 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eftud2O08810 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms