Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp35M0QWN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp35M0QWN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp35M0QWN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp35M0QWN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp35M0QWN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp35M0QWN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms