Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl4M0QW46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl4M0QW46 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl4M0QW46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl4M0QW46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl4M0QW46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl4M0QW46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms