Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim18J3QNP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim18J3QNP2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim18J3QNP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim18J3QNP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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