Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20918J3QN17 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20918J3QN17 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20918J3QN17 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20918J3QN17 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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