Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbip1J3QMK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bbip1J3QMK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbip1J3QMK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbip1J3QMK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bbip1J3QMK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bbip1J3QMK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms