Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm21411J3KMS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21411J3KMS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21411J3KMS0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21411J3KMS0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21411J3KMS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21411J3KMS0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms