Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1700067P10RikG3X8U2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700067P10RikG3X8U2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700067P10RikG3X8U2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700067P10RikG3X8U2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700067P10RikG3X8U2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700067P10RikG3X8U2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700067P10RikG3X8U2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700067P10RikG3X8U2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700067P10RikG3X8U2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms