Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4cG3UXD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4cG3UXD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Speer4cG3UXD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4cG3UXD1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4cG3UXD1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4cG3UXD1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms