Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20517G3UVU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20517G3UVU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20517G3UVU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms