Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XntrpcF8VQM8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XntrpcF8VQM8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XntrpcF8VQM8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XntrpcF8VQM8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XntrpcF8VQM8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XntrpcF8VQM8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms