Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17093F6XGJ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17093F6XGJ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17093F6XGJ4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17093F6XGJ4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17093F6XGJ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms