Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L6

Foxn2, Forkhead box N2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn2E9Q7L6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxn2E9Q7L6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxn2E9Q7L6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxn2E9Q7L6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxn2E9Q7L6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxn2E9Q7L6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxn2E9Q7L6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms