Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6X9

Arhgap40, Rho GTPase-activating protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap40E9Q6X9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap40E9Q6X9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap40E9Q6X9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap40E9Q6X9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap40E9Q6X9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap40E9Q6X9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap40E9Q6X9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms