Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r56E9Q4U5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r56E9Q4U5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r56E9Q4U5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms