Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Susd1E9Q3H4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Susd1E9Q3H4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Susd1E9Q3H4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd1E9Q3H4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms