Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r238E9Q373 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r238E9Q373 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r238E9Q373 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r238E9Q373 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r238E9Q373 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms