Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8127E9Q0P0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8127E9Q0P0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8127E9Q0P0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8127E9Q0P0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8127E9Q0P0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8127E9Q0P0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8127E9Q0P0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8127E9Q0P0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8127E9Q0P0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8127E9Q0P0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms