Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4450E9Q007 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4450E9Q007 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4450E9Q007 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm4450E9Q007 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4450E9Q007 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm4450E9Q007 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm4450E9Q007 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm4450E9Q007 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm4450E9Q007 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm4450E9Q007 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms