Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sbf2E9PXF8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbf2E9PXF8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sbf2E9PXF8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbf2E9PXF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbf2E9PXF8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sbf2E9PXF8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sbf2E9PXF8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms