Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Triml2E9PW10 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Triml2E9PW10 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Triml2E9PW10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Triml2E9PW10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Triml2E9PW10 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Triml2E9PW10 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Triml2E9PW10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Triml2E9PW10 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Triml2E9PW10 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Triml2E9PW10 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Triml2E9PW10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Triml2E9PW10 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Triml2E9PW10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Triml2E9PW10 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Triml2E9PW10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms