Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm9008E9PVG0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm9008E9PVG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm9008E9PVG0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm9008E9PVG0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm9008E9PVG0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm9008E9PVG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms