Protein–RNA interactions for Protein: E5FYH1

Topaz1, Testis- and ovary-specific PAZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topaz1E5FYH1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Topaz1E5FYH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Topaz1E5FYH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Topaz1E5FYH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Topaz1E5FYH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Topaz1E5FYH1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Topaz1E5FYH1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Topaz1E5FYH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
Topaz1E5FYH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Topaz1E5FYH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Topaz1E5FYH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Topaz1E5FYH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Topaz1E5FYH1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Topaz1E5FYH1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Topaz1E5FYH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Topaz1E5FYH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Topaz1E5FYH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Topaz1E5FYH1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms