Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wscd2D4PHA7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wscd2D4PHA7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wscd2D4PHA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wscd2D4PHA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms