Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms