Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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