Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc13D3YV10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc13D3YV10 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc13D3YV10 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc13D3YV10 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms