Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrnnD3YUU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CrnnD3YUU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CrnnD3YUU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrnnD3YUU6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrnnD3YUU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrnnD3YUU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms