Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Catsperg2C6KI89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Catsperg2C6KI89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Catsperg2C6KI89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Catsperg2C6KI89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Catsperg2C6KI89 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsperg2C6KI89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Catsperg2C6KI89 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Catsperg2C6KI89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsperg2C6KI89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms