Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apba1B2RUJ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba1B2RUJ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba1B2RUJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba1B2RUJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms